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Cell：高脂饮食诱发肝癌的"慢性代谢应激"机制

Cell——[42.5]

① 有计划配景与瞎想：本有计划聚焦慢性代谢应激辅导肝癌的细胞机制，通过构建小鼠高脂饮食（HFD）永久模子，结合单细胞多组学及空间转录组时间，绘图了肝脏多细胞得当性演变图谱。② 中枢发现：HFD虽未径直致癌，但辅导非鼎新肝细胞激活促活命及发育关系才略，这种得当性重塑为数月后的肿瘤发生埋下了“致癌运行”隐患。③ 肝细胞去分化特征：肝细胞在代谢压力下阐扬出分化特征丧失与发育才略激活，包括要道转录因子 HNF4A 和酮体生成限速酶 HMGCS2 的显赫下调及 SOX4 的非常上调。④ 代谢酶缺失驱动：功能考据标明 HMGCS2 的抒发缺失不仅是代谢得当的放弃，更是驱动肝细胞参加致癌前情景的要道因素，径直加快了后续肿瘤的发生。⑤ 表不雅遗传调控机制：愚弄开拓的MATCHA算法分析发现，转录因子 SOX4 和 RELB 通过重塑染色质可及性，协同调控了肝细胞从稳态向应激得当及肿瘤易感情景的鼎新。⑥ 空间微环境互作：空间转录组揭示了特异性的多细胞微环境，其中疤痕关系巨噬细胞（SAMac）通过分泌 IL32、LTB 及 JAG1 等信号分子，经旁分泌阶梯保管肝细胞的应激得当情景。⑦ 临床鼎新价值：这种由代谢驱动的“应激-发育”基因抒发特征在东谈主类代谢功能繁难关系脂肪性肝炎（MASH）患者中显赫富集，并能有用分层预测肝癌患者的预后活命。

【原文信息】

Hepatic adaptation to chronic metabolic stress primes tumorigenesis

2025-12-22 , doi: 10.1016/j.cell.2025.11.031

于君/黄子隽等：m6A阅读器YTHDF1激活Notch，促肠癌化疗耐药

Signal Transduction and Targeted Therapy——[52.7]

① CRC干细胞调控机制有计划：本有计划结合类器官、Lgr5特异性基因修饰小鼠及临床样本，探究m6A阅读卵白YTHDF1在结直肠癌（CRC）干细胞保管及化疗耐药中的作用。② 中枢发现与风趣：有计划发现YTHDF1是CRC干细胞的要道驱动因子，其高抒发与不良预后关系，建设了其动作克服化疗耐药新靶点的潜能。③ 促进NOTCH1卵白翻译：机制上，YTHDF1径直结合NOTCH1 mRNA 3'UTR处的m6A位点，以m6A依赖性神气促进NOTCH1翻译，从而激活Notch信号通路。④ 体内考据促癌功能：愚弄Lgr5-Cre驱动的Ythdf1敲入小鼠阐述，YTHDF1显赫加快CRC发生并导致对奥沙利铂/5-氟尿嘧啶耐药，而敲除该基因或使用γ-分泌酶遏制剂DAPT阻断Notch信号通路可逆转此表型。⑤ 纳米药物增效化疗：开拓装载siRNA的纳米颗粒（VNP）或使用小分子遏制剂丹参酚酸C靶向YTHDF1，能显赫遏制肿瘤滋长并协同增强化疗药物的抗肿瘤疗效。

【原文信息】

YTHDF1 targets the chemotherapy response by suppressing NOTCH1-induced stemness in colorectal cancer

2025-12-22 , doi: 10.1038/s41392-025-02507-1

朱立新/秦环龙/王继锋/朱瑞新等：1100+样天职析"孤苦症"微生物基因变异

Cell Reports Medicine——[10.6]

① 多组学部队有计划瞎想：本有计划整合1100余名儿童的肠谈宏基因组与代谢组数据，系统探究孤苦症谱系繁难（ASD）关系的微生物基因组变异过火代谢调控机制。② 中枢发现和恶果：有计划发现微生物基因组结构变异、插入/缺失变异与单核苷酸多态性通过调控神经活性代谢物影响ASD病理，构建了高精度的多组学会诊模子。③ 微生物基因组变异特征：识别出35种互异物种及多数基因组变异，发现Prevotella copri佩带多类变异，而Subdoligranulum sp.等虽丰采不变但存在显赫序列互异。④ 变异与代谢互作机制：微生物变异通过谷氨酰胺等28种神经关系代谢物介导宿主表型，如E. rectale的BtuD基因变异通过鼎新维生素B12转运影响咖啡因代谢。⑤ 高效多组学会诊模子：构建包含微生物丰采、功能基因及变异的20个生物记号物模子（AUC=0.96），在9套孤苦考据部队中阐扬矜重（Median AUC=0.78）且特异性区别精神分裂症、ADHD等疾病。

【原文信息】

Integrative multi-omics reveals microbial genomic variants driving altered host-microbe interactions in autism spectrum disorder

2025-12-19 , doi: 10.1016/j.xcrm.2025.102516

辛凤姣等：AlphaFold+卵白工程，挖出高效"苯丙氨酸"裂解酶

Food Chemistry——[9.8]

① 有计划配景与瞎想：本有计划针对现存苯丙氨酸（L-Phe）氨裂解酶（PAL）热巩固性差及底物特异性不及等问题，在大肠杆菌中异源抒发并纯化了念珠藻（Nostoc sp. ATCC 53789） 开首的新式酶 NoPAL，并结合 AlphaFold3 结构预测进行感性瞎想。② 中枢发现与风趣：NoPAL 展现出优异的热巩固性和严格的 L-Phe 底物特异性，其突变体 S73N 在多种食用卵白水解物中齐全了高达 95% 的 L-Phe 去除率，为酶法工业化坐褥低苯丙氨酸卵白及开拓苯丙酮尿症（PKU）饮食治愈有瞎想提供了首要的时间基础。③ 酶学性质表征：NoPAL 的最适反应温度为 55°C，在 70°C 孵育 2 小时后仍保留 90% 活性，热巩固性较生意化 Anabaena variabilis PAL 提高 40%，且在 pH 4.0–11.0 界限内保执极佳巩固性。④ 结构导向校正：通过对活性位点内盖环进行感性瞎想筛选出 S73N 等 4 个催化性能提高的突变体，其中 S73N 的催化效率较野生型提高 2.3 倍，且其热变性温度（74.1°C）与野生型很是，标明突变在提高活性的同期未影响结构巩固性。⑤ 试验应用考据：愚弄突变体 S73N 处理酪卵白酸水解物、乳清卵白水解物和大米卵白水解，L-Phe 去除率分别达到 87%、95% 和 86.7%，显赫优于现存生意酶制剂，且未袭击其他氨基酸构成，有用保留了产品的养分价值。

【原文信息】

Improving the catalytic efficiency of a highly thermostable phenylalanine ammonia-lyase from Nostoc sp. ATCC 53789 and its application in producing low L-phenylalanine protein

2025-12-18 , doi: 10.1016/j.foodchem.2025.147493

李向东等：水产衍生"残留抗生素"或促进耐药金葡菌肠黏膜定植

Gut Microbes——[11]

① 有计划配景与模子构建：本有计划针对水产衍生中抗生素残留的健康风险，愚弄东谈主肠谈微生物生态系统黏膜模拟器（M-SHIME），探究了食物残留级环丙沙星（CIP）对耐药金黄色葡萄球菌（S. aureus）定植的影响。② 中枢发现：食物残留级CIP显赫促进耐药S. aureus在肠谈黏膜的特异性定植，并加多与东谈主类疾病及感染关系功能的抒发，袭击肠谈微生态稳态。③ 隔室特异性生态反应：菌群呈现出显赫的空间互异，肠腔微生物受CIP遏制严重并转向压力耐受政策，而黏膜微生物则增强了资源获得、生物膜造成及群体感应武艺。④ 微生物收集互作机制：收集分析自满黏膜菌群里面正向关联增强，造成复杂的伙同收集，且特定的黏膜共生菌（如扭链瘤胃球菌）可能通过黏液零碎向肠腔转移。⑤ 耐药基因宿主富集：集合披露导致肠腔和黏膜中佩带抗生素耐药基因的细菌的相对丰采高潮，且部分要道耐药菌（如Prevotella intermedia）在收齐集占据中枢位置。⑥ 食物安全与健康启示：该有计划阐述肠谈黏膜是耐药菌定植的要道微环境，请示现时食物安全轨范可能低估了低剂量抗生素残留辅导耐药菌传播的潜在风险。

【原文信息】

Food-residue-level antibiotics promote mucosal colonization of foodborne antibiotic-resistant Staphylococcus aureusin a simulated human gut

2025-12-15 , doi: 10.1080/19490976.2025.2599517

NC：无需节食，健康北欧饮食全面改善糖尿病脂肪肝

Nature Communications——[15.7]

① 有计划配景与瞎想：本有计划针对2型糖尿病销毁脂肪肝的饮食侵略难题，开展为期12个月的就地对照训诫，对比低碳高多不填塞脂肪酸饮食（LCPUFA）、健康北欧饮食（HND）与旧例照看对150名患者的代谢影响。② 中枢发现与价值：两组侵略饮食均能显赫约束肝脏脂肪，但HND在不刻意收尾热量的前提下特等改善了体重、血糖及炎症主见，展现出更优的笼统代谢获益。③ 肝脏脂肪改善：MRI分析自满，与旧例照看比拟，LCPUFA组和HND组肝脏脂肪含量分别实足约束1.46%和1.76%，且在不同PNPLA3基因型亚群中效果矜重。④ HND的代谢上风：比拟于LCPUFA组，HND组在约束糖化血红卵白（HbA1c）、松开体重及改善胰岛素违反方面阐扬更佳，且齐全了53.6%的NAFLD缓解率。⑤ 血脂与炎症调控：仅HND组同期显赫约束了甘油三酯、肝酶（ALAT/ASAT）及C反应卵白水平，而LCPUFA组虽约束了LDL胆固醇但未显赫改善炎症主见。⑥ 遵命性与安全性：通过血浆磷脂脂肪酸谱系考据了讲求的饮食遵命性，全有计划时分虽纪录4例严重不良事件但均与饮食侵略无关，阐述了永久应用的安全性。⑦ 临床应用远景：有计划建设了HND动作一种无需严格诡计卡路里即可有用惩处2型糖尿病及代谢功能繁难关系脂肪肝病的可行临床养分政策。

【原文信息】

Effects of an anti-lipogenic low-carbohydrate high polyunsaturated fat diet or a healthy Nordic diet versus usual care on liver fat and cardiometabolic disorders in type 2 diabetes or prediabetes: a randomized controlled trial (NAFLDiet)

2025-12-13 , doi: 10.1038/s41467-025-65613-2

NC：因祸得福？化疗损害辅导菌群代谢物IPA，重塑骨髓防转移

Nature Communications——[15.7]

① 有计划瞎想：本有计划结合小鼠结直肠癌（CRC）肝转移模子与临床患者部队，探究了化疗引起的肠谈损害若何通过菌群代谢产品建设长效的抗转移“化疗顾虑”。② 中枢发现与风趣：化疗导致的肠谈黏膜炎通过重塑菌群代谢，加多血清吲哚-3-丙酸（IPA）水平，从而重编程骨髓造血功能，收尾免疫遏制性细胞生成并阻断肝转移。③ 肠谈菌群代谢重塑：化疗损害以至肠腔内多肽齐集，促进厚壁菌门 梭菌纲细菌扩增及色氨酸代谢增强，导致轮回中IPA浓度显赫升高。④ 骨髓造血运谈重写：IPA参加骨髓径直作用于共同髓系祖细胞（CMPs），通过上调Rbpj、Mafb和Irf8等转录因子激活Notch信号，促进巨噬细胞纯熟，遏制Ly6ChighCCR2+ 单核细胞的输出。⑤ 免疫微环境平淡化：轮回中免疫遏制性单核细胞的减少根除了对T细胞的遏制，促进肝转移灶内Th1细胞扩增及与CD8+ T细胞的空间重排，增强抗肿瘤免疫。⑥ 临床预后记号物：CRC患者化疗后血清IPA升高与外周血单核细胞减少呈显赫负关系，且高单核细胞水平预示总活命期裁汰，请示IPA可动作潜在扶持治愈制剂。

【原文信息】

Chemotherapy-driven intestinal dysbiosis and indole-3-propionic acid rewire myelopoiesis to promote a metastasis-refractory state

2025-12-15 , doi: 10.1038/s41467-025-67169-7

刘超/张艳桥等：靶向CTGF领会基质障蔽，破大肠癌免疫治愈耐药

Cell Reports Medicine——[10.6]

① 有计划配景与瞎想：本有计划针对结直肠癌中CSF1R遏制剂耐药难题，愚弄同种异体移植瘤、类器官及PDX模子，结合成像质谱流式（IMC）贯通耐药机制。② 中枢发现：CSF1R遏制剂不测激活PI3K/AKT通路辅导肿瘤细胞分泌结缔组织滋长因子（CTGF），通度日化成纤维细胞构建免疫障蔽；集合靶向CTGF可克服耐药。③ 遏制剂疗效局限：纪念性部队与小鼠实考据实，CSF1R遏制剂PLX3397虽能有用耗竭肿瘤关系巨噬细胞，但因代偿性基质重塑未能遏制肿瘤滋长，临床莽撞率极低。④ 基质障蔽与免疫搁置：IMC分析自满治愈后肿瘤微环境发生空间重塑，CTGF驱动癌关系成纤维细胞（CAFs）富集，在肿瘤中枢造成物理障蔽遏抑CD8+ T细胞浸润。⑤ 信号通路调控机制：RNA-seq与生化实考据实，CSF1R阻断剂通过上调PI3K/AKT信号通路磷酸化水平，辅导肿瘤细胞显赫加多 Ctgf 的转录与卵白分泌。⑥ 逆转耐药要道靶点：在体表里模子中，敲除 Ctgf 或使用中庸抗体可阻断CAFs活化及胶原千里积，获胜规复CD8+ T细胞向肿瘤本色的招募。⑦ 三联疗法鼎新后劲：建设“CSF1R遏制剂+抗CTGF+抗PD-1”三联疗法，在多种小鼠模子及东谈主源化PDX模子中齐全完全的肿瘤消退，为临床治愈提供新政策。

【原文信息】

Targeting CTGF overcomes resistance to CSF1R inhibitors by preventing CAF activation in colorectal cancer

2025-12-16 , doi: 10.1016/j.xcrm.2025.102480

Nature子刊：核磷卵白NPM1是WNT驱动肠肝肿瘤的幕后推手

Nature Genetics——[29]

① 有计划配景与瞎想：针对实体瘤NPM1过抒发征象，愚弄 Apc 缺失及 Kras 突变小鼠模子，贯通其在WNT驱动肠癌与肝癌中的作用机制。② 中枢发现与风趣：揭示 Npm1 是WNT通路要道效应因子，通过缓解核糖体停滞应激及遏制p53激活保管肿瘤肇端，且对平淡组织稳态非必需。③ 抒发特征与临床关系性：转录组阐述 Npm1 在WNT激活组织中显赫上调；东谈主结直肠癌中高水平NPM1卵白与WNT信号及细胞增殖呈正关系。④ 遏制肿瘤肇端：在 Apc 及 Kras 肠癌模子中，特异性敲除 Npm1 显赫遏制WNT驱动的超增殖与成瘤，延迟活命期，且不袭击上皮稳态。⑤ 辅导核糖体停滞：核糖体图谱分析自满，Npm1 缺失导致核糖体在编码序列（CDS）5'端粗野停滞，激励特异性翻译压力。⑥ 应激与p53机制：翻译颓势激活整合应激反应（ISR）及p53通路；使用ISR遏制剂或敲除 Trp53 / Cdkn1a 可完全逆转该抑癌效应。⑦ 肝癌模子考据：在WNT/MYC 肝癌模子中，Npm1 缺失雷同通过辅导ISR和p21抒发，显赫减速肿瘤进展并减少肺转移。

【原文信息】

Nucleophosmin supports WNT-driven hyperproliferation and tumor initiation

2025-12-18 , doi: 10.1038/s41588-025-02408-7

NC：间歇性禁食减重降脂，但肠谈GLP-1信号被抑

Nature Communications——[15.7]

① 有计划配景与瞎想：本有计划礼聘就地对照训诫瞎想，评估6个月间歇性禁食（IF）对41名超重中年东谈主的腹黑代谢影响，并通过结肠黏膜转录组学与血浆代谢组学贯通其分子机制。② 中枢发现与风趣：IF显赫约束体重与致动脉粥样硬化血脂水平，但未改善胰岛素违反或系统性炎症，请示IF主要通过特定的脂代谢与肠谈免疫鼎新旅途阐明作用。③ 体因素与血脂改善：IF组齐全了约8%的体重松开和16%的体脂下落，LDL-C、非HDL-C及甘油三酯显赫约束，且非HDL-C的改善孤苦于血糖和血压的变化。④ 多组学机制贯通：结肠转录组分析自满IF下调了肠内分泌信号通路，具体阐扬为GCG（胰高血糖素）和PYY等GLP-1合成关系基因的抒发显赫受抑。⑤ 血脂调控关联：非HDL-C的约束与基线PPARA（过氧化物酶体增殖物激活受体α）基因的高抒发呈正关系，并跟随B细胞免疫通路及IgA同型转念的鼎新。

【原文信息】

Cardiometabolic and molecular adaptations to 6-month intermittent fasting in middle-aged men and women with overweight: secondary outcomes of a randomized controlled trial

2025-12-13 , doi: 10.1038/s41467-025-66366-8

减填塞脂肪摄入，仅高危者获益且多不填塞脂肪替代最好

Annals of Internal Medicine——[15.2]

① 系统综述与瞎想：本有计划整合了17项就地对照训诫共66337名受试者数据，系统评估了约束或调整填塞脂肪摄入对血脂、圆寂率及主要心血行状件的影响。② 中枢发现与风趣：有计划通过风险分层阐述，约束填塞脂肪摄入的临床获益高度依赖于基线风险，明确指出该侵略主要为高危东谈主群带来具有首要风趣的实足风险约束。③ 总体侵略效应：低至中度详情味的把柄自满，约束填塞脂肪摄入可能导致全因圆寂率、心血管圆寂率及非致死性心肌梗死（MI）风险的微小下落。④ 低风险东谈主群分析：对于基线心血管风险较低的东谈主群，侵略设施在5年内产生的致死性及非致死性结局实足风险约束幅度极小，未达临床首要性阈值。⑤ 高风险东谈主群获益：针对高风险东谈主群，约束填塞脂肪摄入带来的实足获益显赫逾越预设阈值，请示该侵略政策对此类东谈主群具有明确的临床把稳价值。⑥ 养分素替代效应：亚组分析标明，当以多不填塞脂肪酸替代填塞脂肪时，约束非致死性MI风险的效果最为显赫（RR 0.75），且该效应具有中度真正性。⑦ 有计划局限与瞻望：现在对于单不填塞脂肪酸或卵白质替代填塞脂肪的数据还是有限，且各训诫侵略效劳存在异质性，仍需新训诫进一步考据。

【原文信息】

Effect of Interventions Aimed at Reducing or Modifying Saturated Fat Intake on Cholesterol, Mortality, and Major Cardiovascular Events : A Risk Stratified Systematic Review of Randomized Trials

2025-12-16 , doi: 10.7326/ANNALS-25-02229

牛油果替代糖油，显赫改善血脂谱

American Journal of Clinical Nutrition——[6.9]

① 有计划配景与瞎想：本项就地双盲交叉训诫波及42名血脂非常伴超重成东谈主，对比逐日摄入180克牛油果等热量替代固态脂肪和添加糖的3周饮食侵略效果。② 中枢发现与风趣：有计划阐述该替代政策能显赫改善脂卵白谱，尤其是约束致动脉粥样硬化关系的胆固醇主见，为心血管代谢风险惩处提供了饮食新依据。③ 血脂主见显赫优化：侵略组非高密度脂卵白胆固醇（non-HDL-C）约束4.65%，甘油三酯约束17.4%，且小颗粒低密度脂卵白（small LDL）显赫减少13.9%。④ 养分素替代机制：代谢获益主要源于用单不填塞脂肪酸和膳食纤维替代了促炎的填塞脂肪酸及添加糖，而非单纯加多总脂肪摄入。⑤ 血糖血压无互异：尽管血脂显赫改善，但两组间的空心血糖、胰岛素明锐性、血压及体重变化均无统计学显赫互异。⑥ 安全性与遵命性：受试者对逐日食用牛油果的遵命性高达92.8%，虽有微小胃肠谈反应，但考据了将牛油果融入日常好意思式饮食的可行性。

【原文信息】

Effects of Replacing Solid Fats and Added Sugars with Avocado in Adults with Elevated Cardiometabolic Risk: A Randomized, Double-Blind, Controlled Feeding, Crossover Trial

2025-12-13 , doi: 10.1016/j.ajcnut.2025.101137